从战术层面来看，MS本就适合用于侦察任务。有着比主战坦克更强大的装甲防御力，超越宇宙战机的机动性，以及装备了高精度的光学相机，在米诺夫斯基粒子散步环境下生存性强，因此特别适合被用于搜集情报。
而在对上述优点进行评测后，吉翁在一年战争开战以前就开始着手进行侦察用MS的开发，并以以MS-06C 扎古II C型为基础进行设计，开发出了MS-06E 强行侦察型扎古Ⅱ。不过在设计完成后，吉翁就将MS-06F 扎古II F型作为主力量产机。所以之后也用阿巴瓦空和所罗门的扎古II F型的产线进行了制造。
穿梭在联邦舰队中的强行侦察型扎古Ⅱ
使得之后的机体是从扎古II F型的生产线抽出的机体为基础，将装甲削减至最低限度，在确保有效载荷的同时，增设侦察用的各类传感器和电子设备。
光学系统的增强是通过增设光学相机和采用手持式照相枪来完成的。强行侦察型扎古Ⅱ去除了扎古II极富特征的盾牌和肩甲，并将其替换为肩部的光学相机，除此之外还在股部增设了光学相机，但依旧保留了兵装运用能力。
装备的CE-16X相机枪，作为一台手持式光学相机，外置式摄像机比内置式摄像机更容易实现大型化
头部也换装了大口径高精度的单眼式相机，不仅将其大型化，还增设了头顶方向的扩大版扫描轨道。此外还在头部左侧增设了短距离通信用天线。而改造后的强行侦察型扎古Ⅱ以极高的信息处理能力为傲。
头部、右肩、左肩、股间的顺序分别为第1、2、3、4相机单元。头部单眼相机上的玻璃面罩被取消，而扎古I狙击型也打在了同系的单眼相机
这样的改装也导致成本水涨船高，造价不低。据说MS-06E的产量不足100台。但从一年战争初期开始就反复进行整修，并持续运用至今。另外当初的型号编号为RMS-06，但由于为了型号编号的统一而变更为MS-06E。
强行侦察型扎古Ⅱ的预想任务除了通常的警戒/侦察任务外，还设想过突入敌人中进行强行侦察。因此其机体的推力必然不小，其推进背包是以MS-06S 扎古II S型的改良型大功率推进器为基础改进而来了新型推进背包，其总推力约为13吨。
以扎古II S型的推进背包为基础，改进而来的推进背包搭载两台火箭推进器共计推力130吨。推进背包本身也是新造的，上方的动力管线和头部相连。
而为了让机体能从敌阵中幸存下来，还在胸部还设置了紧急逃生用火箭。和常用的双肩推进器不同，紧急脱离时额外的火箭推进器可以和推进背包一起发挥出惊人的推力，而这惊人的G力似乎也是机师必须身穿重型标准服的原因之一。
胸部的紧急逃生用火箭
另外由于机体削减了武装，因此多出了其燃料搭载量多出了10%，并在胫部设置了内置式燃料箱和姿态控制喷口。
该机在开战后不久就开始投入使用，在战争后期被击坠的例子并不多，各方面表现都很不错。当然也有在战争初期于月神II被击坠、缴获的强行侦察型扎古Ⅱ。但据说对地球联邦军实施了强行侦察，甚至侵入了设施内。
强行侦察型扎古Ⅱ
在战后被联邦军接收后，也被联邦军编入了自身的部队编制中。原先联邦军的侦察在地面上依靠飞机，而在太空中则是通过侦察舱和辅助舰艇来实现的。不过随着以小队规模运用MS逐渐称为主流的实情来看，能和僚机步调一致的侦察用MS或许更适合当今的战场环境。
但是对于战后被处理夺走预算而囊中羞涩的联邦军来说，开发新的并生产高价电子设备的侦察用MS并不可能。因此在这样的背景下只能对MS-06E进行改装，驾驶舱周围进行了近现代化改装，配备了全周天驾驶舱和线性座椅，手部还增设了固定器等。即便如此，部队中的侦察用MS数量还是十分稀少。据说提坦斯在组建MS部队时，也从正规军部队中相中了此机并将其征用。
格林普斯战争期间的强行侦察型扎古Ⅱ
而之后该机地球联邦军和提坦斯投入到了实战中，由此可见，即使战争结束了7年之久，其性能仍然十分强大。
该机在UC 0085年10月时，还曾使用飞行踏板在大气环境下记录海兹尔测试运用的相关数据。
UC 0085年10月，正在记录海兹尔运用数据的强行侦察型扎古Ⅱ
而在格林普斯战争中，被派出去监视月面上的进入安曼港的亚伽玛，有着帽子店的呼号。而当亚历山大号对亚伽玛展开舰炮射击式，也结合了该机的信息处理能力进行了瞄准修正。不过最终被百式发现并被击破。
在月面侦察亚伽玛的强行侦察型扎古Ⅱ
但是提坦斯高层也明白，再怎么进行近现代化改装，延长强行侦察型扎古Ⅱ的使用寿命终究是有限度的。于是月神II工厂也开工以RMS-106高扎古为基础开发新型侦察用MS。到了格林普斯战争中期时，新一代的机体RMS-119侦察型高扎古也开始逐渐替换强行侦察型扎古Ⅱ为新一代侦察用机种。
画廊
吉翁使用的强行侦察型扎古Ⅱ配色
提坦斯使用的强行侦察型扎古Ⅱ配色
被百式摧毁的强行侦察型扎古Ⅱ
装备120mm机枪的强行侦察型扎古Ⅱ
太空中的强行侦察型扎古Ⅱ
强行侦察型扎古Ⅱ
游戏中的强行侦察型扎古Ⅱ
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