
无论是学习流式细胞术相关知识,查询实验方法,提升实验方案设计能力,学习实验数据分析,了解前沿进展,结交良师益友,还是贡献经验和想法,都已有成熟的平台或社区。这里整理了一些非常优秀的学习型平台/工具/资源,供大家参考学习!内容较多,建议收藏!
1.《Practical Flow Cytometry》--流式细胞术/细胞仪应用专业知识
电子书下载地址:https://pan.quark.cn/s/61a9195ab658
对于任何有兴趣了解流式细胞术技术或有兴趣发展流式细胞仪应用专业知识的人来说,《Practical Flow Cytometry》是一本经典的参考书。
这本书详细介绍了使用激光激活检测和细胞分选的定量分析细胞学的广泛生物医学应用。现在是第四版,本书已经扩展,全面涵盖了当今分子生物学和生物技术的广泛应用。
本版新增了有关阵列技术自动分析、补偿、高速分选、报告分子以及多重和细胞凋亡检测的章节,以及全面更新和修订的参考文献和供应商名单。

2.Whitehead Institute--开放性的流式细胞术学习平台
①Open flow initiative
网站:https://wi.mit.edu/open-flow-cytometry-videos
Open Flow是一个开放获取的流式细胞术教育资源平台。Open Flow 的现场互动课程每月举行一次,注册的人都可以免费参加学习。Open Flow 计划是弗朗西斯·克里克研究所(英国伦敦)、纪念斯隆凯特琳癌症中心(美国纽约州)和怀特黑德生物医学研究所(美国马萨诸塞州剑桥)之间的合作项目。

②Flow Post-Its
网站:https://wi.mit.edu/flow-cytometry-core/resources/flow-post-its
Flow Post-Its诞生于纪念斯隆凯特琳癌症中心,现在是与怀特黑德生物医学研究所的合作教育项目。这里有非常多改进流式细胞术实验的提示和技巧,他们把每一个实验经验做成了图文式的便利贴,方便我们查阅与学习。

3.Vendor websites--供应商网站
供应商官方网站是一个很好的技术信息资源来源渠道,他们通常还提供protocols、技术支持和教育资源。有流式技术学习的主要供应商包括BD Bioscences、Cytek Bioscenes、 Beckman Coulter、 ThermoFisher、 Abcam和Biolegend等。大家可以在这些供应商品牌的官网上找到很多流式学习资料,他们提供的protocols、技术支持和教育资源都是技术人员经过实验验证的多年经验总结。
4.流式技术总结资料
1)流式细胞分析实验方案手册及标志物指南
流式细胞分析实验方案手册
2024版-流式细胞术检测外周血淋巴细胞亚群指南
实用流式细胞仪采购指南
免疫细胞分型指南
人和小鼠免疫细胞免疫分型的最佳标记物指南
常见各免疫细胞亚群的百分比
2)其它流式技术资料总结
人血小板高参数表型的16色流式检测方案
常见流式样本的保存方法及注意事项
流式补偿以及补偿微球调节使用
流式和固定中常见的问题
流式结果异常常见问题分析
死活染料、封闭、补偿微球相关问题汇总
以上所有资料,有需要可以在下方下载!

1.Cytometry Part A
Cytometry Part A是一本定量单细胞分析杂志,以采用定量单细胞测量、分离、操作和建模技术的创新科学研究的原始研究报告和综述为特色。
Cytometry Part A上发表的OMIP,是经过同行评审的,旨在报道用于流式细胞术、荧光显微镜、成像细胞术和其他基于多色荧光的方法的新设计和优化的多色面板。
2.Current Protocols in Cytometry
这本期刊全面收集细胞术protocols,专注于各种细胞群的检测和分析,包括仪器设置、数据处理和分析以及细胞和分子成像。
1.International Society for Advancement of Cytometry(ISAC) and Cytometry University (CYTO U)
①ISAC是全球细胞检测专业人员社区。ISAC的会员拥有大量的教育和网络学习机会,ISAC每年组织一次年度盛会(CYTO)。
网站:https://isac-net.org/?

②CYTO U是ISAC的一个在线门户网站,用于按需、同行评审的细胞术教育。该网站提供多模块课程、提供CYTO会议的和网络讨会系列的录制内容。
网站:https://learning.isac-net.org/

2.专业协会(Professional societies)
成为当地、地区、国家或国际细胞术专业协会的成员,将在那里获得学习、指导和建立联系的机会。此类组织包括:
ACS(澳大拉西亚细胞术学会)
LatinFlow(伊比利亚美洲国家细胞术学会)
flowcytometryUK(英国细胞术学会)
此外,这些学会针对中心实验室专业会员提供有关细胞术学习和跟踪内容:
CTLS(生命科学核心技术Core Technologies for life sciences)
ABRF(生物分子资源设施协会Association of Biomolecular Resource Facilities)
3.The Cytometry Society-INDIA(TCS,INDIA)
网站:https://tcs.res.in/about-society.php
该组织成立于2005年,组织研讨会(有/无SAC协会)和课程,并在印度提供了几份细胞术资源材料。

4.Purdue Cytometry List
网站:http://www.cyto.purdue.edu/
普渡大学PUCL细胞术讨论列表建立于1989年,讨论内容向所有科学家开放,让他们提出问题或讨论细胞术领域关注的话题。

5.CyTOForum
网站:http://cytoforum.stanford.edu
CyTOForum成立于2014年,是一个面向所有质谱细胞术的开放式在线交流论坛。

6、交流社群
我们把所有在做流式的老师们聚集在了一个微信群内,群内也有技术老师,有任何问题可以在群内求助,人多力量大,可以一起解决问题!
宝子们,生科人实验互帮互助微信群建好了!wb、流式细胞术、PCR、免疫组化、Elisa... - 哔哩哔哩

1.FlowRepository
网站:http://flowrepository.org/
FlowRepository是一个流式细胞术实验数据库,你可以在其中查询和下载根据MIFlowCyt标准(参考文献)收集和注释的数据。它主要用作发表在同行评审期刊上的实验结果的数据存放处。可以使用下面的表格和链接查询或浏览这些数据集。


2.RRID
网站:https://scicrunch.org/resources
研究资源标识符(#RRID)是分配给研究人员的ID号,用于帮助研究人员引用生物医学文献中的关键资源(抗体、模型生物和软件项目),以提高研究方法的透明度。

在流式多色实验方案设计中,除了试供应商帮我们设计Panel外,其实我们还可以查找资料,利用一些工具去更有效率,更完美的设计我们的实验方案。
1.FluoroFinder
网站:https://fluorofinder.com/
FluoroFinder的网站收集了开始流式细胞术实验设计所需的资源,提供了综合抗体搜索、交互式仪器配置或光谱查看器等工具。
针对OMIP的文献进行了整理,把其中用到的抗体进行整理列表,查起来非常方便,一目了然,而且这些抗体都是经过验证的,用起来更可靠。

2、Optimized Multicolor Immunofluorescence Panel (OMIP)
网站:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)1552-4930.OMIPscollection
OMIP是一种特殊的同行评审的 Cytometry Part A 出版物类型,报告了用于流式细胞术、荧光显微镜、图像流式细胞术和其他基于多色荧光的方法的新设计和优化的多色检测组合。
在OMIP中我们可以找到不同的Panel设计方案(免疫方向),文献内容包括marker的克隆号,marker表达的细胞类型,设计相应marker的目的,以及圈门策略,panel的评估等。也因此我们可以根据OMIP去设计自己的实验方案,而且还可以进一步加深我们的免疫知识。

3、Flow Cytometry Panel Builder--流式配色工具
官网:https://www.thermofisher.cn/order/panel-builder/#!/
如果问流式细胞术哪部分最困难,多色配色当属其一。流式细胞仪的配置,目标蛋白的表达水平或丰度,荧光染料亮度,荧光激发/发射光谱都是我们要考虑的问题,而综合这些因素需要遵循的基本原则包括:
①强弱搭配 :将亮度更高的荧光染料搭配低丰度蛋白,亮度较低的荧光染料与高丰度蛋白匹配,可减少干扰从而得到更准确的信号。②选择补偿少的荧光组合:挑选光谱重叠低的荧光染料有助于清晰识别多组细胞群。
为了方便配色,Invitrogen专门提供了一款免费的在线配色工具(thermofisher.com/flowpanel),可帮助你选择适合的流式抗体和试剂,优化流式panel,更好地分离和检测单个目标细胞群。
我们之前分享过利用这个流式配色工具进行8色流式配色案例实操,不会流式配色/选荧光染料的可以学习一下。

流式数据分析软件有很多选择,这些软件可与不同的仪器进行兼容,其功能各不相同,尤其是在涉及复杂的工作流程和数据显示选项时。
最常见的分析工具为FlowJo, Cytobank, FCSExpress, Keluza, Modfit LT, WinList等。
FlowJo 安装包:流式行业标杆神器,FlowJo 10 !(破解版)
Cytobank 在线网址:https://www.cytobank.cn/platform.html
FCSExpress 安装包:https://denovosoftware.com/demo-overview/(30天免费试用版本)
Keluza 2.3 安装包:https://pan.quark.cn/s/ae24e07a2d91
ModFitLT 3.2 安装包:https://pan.quark.cn/s/be8d83b0adcc
在选择分析工具时,重要的是要考虑结合研究内容、案例情况、软件功能、所需的许可证数量、许可证定价(独立或分层)以及平台对平台的可访问性(本地或基于云)。
以下表格中整理了各大软件的云计算、双轴设门、HD分析工具、开源、操作系统5个板块的具体信息,以供大家参考。

【统计分析工具】
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