本期将为大家展示聚合物建模+LAMMPS分子动力学模拟+分析方法:
1. Materials Studio建模聚合物分子链;
2. CHARMM-GUI建模聚合物分子链;
3. Python生成随机分布的amorphous聚合物初始结构;
4. 聚合物的分子动力学模拟:包括软势,退火,动力学;
5. 采用Python和MDAnalysis对轨迹进行性能分析:包括MSD(和扩散系数有关),拉伸力学性能,和拉伸过程中链取向。
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