AlphaFold2-EBI数据库存放了模式生物所有编码蛋白的预测结构,如果用该数据库直接进行搜索蛋白结构,需要输入准确具体的名称才能搜索出来。本方法可以对不确定名称的基因或蛋白,按照视频中的流程进行搜索,或者直接对模式生物任意一个编码序列,搜索其预测结构,实现精确搜索。AlphaFold2-EBI数据库预测的蛋白结构范围:20种常用模式生物所有编码蛋白的结构,包括人,大肠杆菌,拟南芥,结核分枝杆菌等等。AlphaFold2对单个蛋白结构的预测,目前在所有AI中是最准的,且与实际实际结构很接近。
出处:Bio-protocol第二届生物实验短视频大赛
作者:中科院分子植物科学卓越创新中心,李国强