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16S测序与生物信息分析

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2019-08-30 10:52:24
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1-课程介绍
08:32
2-微生物与人类
07:49
3-微生物物种分类
09:11
4-微生物鉴定方法比较
10:30
5-16s物种分类
07:43
6-16S样品提取与测序
08:35
7-几种16S测序技术的比较
08:31
8-16S测序分析常用分析流程
09:05
9-16S测序分析常用数据库
10:17
10-18S和ITS数据分析
06:54
11-HMP计划与EMP计划
08:12
12-纪念Carl Woese
07:28
13-测试数据
07:32
14-16S测序数据质控
09:54
15-16S测序数据处理
08:56
16-qiime-base安装
07:38
17-qiime-full安装
07:57
18-qiime虚拟机安装
13:30
19-qiime的使用
08:07
20-mapping文件
05:55
21-序列连接join_paired_ends.py
07:05
22-切分数据split_libraries.py
06:09
23-切分数据split_libraries_fastq.py
07:14
24-去除嵌合体identify_chimeric_seqs.py
05:11
25-OTU物种分类
09:32
26-OTU聚类pick_otus.py
07:59
27-选择代表性OTU序列pick_rep_set.py
07:01
28-参考序列比对align_seqs.py
06:51
29-过滤比对结果filter_alignment.py
04:38
30-构建进化树make_phylogeny.py
05:57
31-物种分类注释assign_taxonomy.py
08:37
32-OTUs table生成make_otu_table.py
06:04
33-biom文件格式
07:26
34-OTU table处理
08:02
35-OTU分析流程pick_open_reference_otus.py（一）
08:47
36--OTU分析流程pick_open_reference_otus.py（二）
10:06
37--OTU分析流程pick_open_reference_otus.py（三）
06:24
38-群落组成分析
08:23
39-绘制OTU 热图
06:47
40-绘制OTU Network图
06:52
41-多样性分析
08:31
42-Beta多样性分析（一）
08:44
43-Beta多样性分析（二）
08:47
44-Beta多样性分析（三）
09:36
45-alpha多样性分析（一）
07:14
46-alpha多样性分析（二）
07:59
47-alpha多样性分析（三）
09:47
48-Rank-Abundance曲线
05:31
49-多样性分析流程core_diversity_analyses.py
07:37
50-16S高级分析
09:07

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