自生信培训班开班以来,目前据不完全统计,学员发表的一区文章已经超过30篇,已经有第一批学员以第一作者在Science子刊发表文章、第三批学员以共一作者在Nature主刊发表文章、第五批学员以第一作者在Cell主刊发表文章。培训班已经成功带领数千名临床医生和科研工作者进阶生信分析,从生信数据挖掘中找到课题研究方向,做出有价值的科学研究。两个月直播教学零基础系统学习单细胞分析,Python作为本次课程的重点分析软件,R语言作为本次课程的系统分析软件,深入剖析18篇CNS文章的分析思路和分析方法,以文章的fig为例进行代码演示和复现学习,个性化分析、进阶分析灵活应用才能产出高质量文章
只有储备足够多的知识和经验(算法和思路)才能完成高质量、高水平文章的数据分析。基本的单细胞数据分析很简单,但是做出个性化分析、有科学意义的分析很难。
>>> 零基础系统班
二个月从零基础开始, 单细胞测序、chipseq、RNAseq、Atacseq 空间转录组和外显子等。
将生信内容全部学懂(理解)、学会(会敲代码分析)、学透彻(站在顶层设计角度理解)、学以致用(用到自己的标书申请和文章发表中)。第一节课:Python系统讲解 ,jupyter notebook的环境搭建和基础知识讲解。第二节课:Linux系统讲解 ,Anaconda的安装和conda环境创建,rstudio-server的系统讲解。第三节课:以Nature文章为例系统讲解单细胞数据质控、归一化处理、PCA降维、聚类、tSNE、UMAP可视化
Nature:Chemical reprogramming of human somatic cells to pluripotent stem cells (2022.04.13-第三批学员为文章一作)
第四节课:Scrublet去除双细胞【Science】,DoubletFinder | 使用ANN算法识别单细胞数据中的Doublet【Nature Medicine】
第五节课:CellTypist 免疫细胞自动注释【Science】,非负最小二乘回归的单细胞注释【Nature】