ssGSEA单样本基因集富集分析，免疫细胞浸润分析的另一种方法
ssGSEA
1 定义：
单样本基因集富集分析（single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA），是GSEA方法的扩展，计算每个样本和基因集配对的富集分数。每个ssGSEA富集评分代表了样本中特定基因集的成员被协调上调或下调的程度。亦是一种基因集浸润分析方法，用于评估单个样本中基因集浸润的情况。它是基于基因表达数据的，通常用于分析基因芯片或 RNA-seq 数据。
2 主要优势：
ssGSEA主要针对单样本无法做GSEA而提出的一种办法，原理上与GSEA类似，也是根据样本表达谱文件计算每个基因的rank值。
3 参考文件
28种免疫相关的基因集（免疫细胞、免疫相关功能、免疫相关通路）。
免疫细胞浸润分析
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简介
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