2018-05-R与Bioconductor的入门课

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2018-06-04 08:04:20
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R与Bioconductor的入门课 如何安装Bioconductor中的包? GRange 到底能干点什么? 如何使用BioStrings处理序列信息? 如何获得任意一段human genome的序列信息? 如何统计human各条染色体的长度及GC含量? 如何使用rtracklayer读取文件(以GTF文件为例)? 如何将不同版本的基因组坐标进行互相转换? 如何将公共数据的ChIP-Seq peak信息与基因结构信息进行批量可视化? 如何使用GEOquery获取发表数据信息?
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视频选集
(1/12)
2018-05-31-01-Bioconductor网站都包括哪些内容
06:05
2018-05-31-02-如何快速学习Bioconductor中的包
02:10
2018-05-31-03-如何安装Bioconductor中的包
02:47
2018-05-31-04-Genomic Ranges 学习
39:50
2018-05-31-05-如何统计human 全部exon的总长度
05:00
2018-05-31-06-学习使用AnnotationHub并下载公共ChIP-Seq数据
06:32
2018-06-03-07-如何使用BioStrings处理序列信息
06:22
2018-06-03-08-介绍BSgenome并获得human genome的长度与GC含量
13:34
2018-06-03-09-如何使用rtracklayer读取文件(以GTF文件为例)
02:51
2018-06-03-10-如何使用chainfile将不同版本的基因组坐标进行互相转换
05:31
2018-06-03-11-如何使用GEOquery获取发表数据信息
10:47
2018-06-03-12-如何使用Gviz将公共数据的ChIP-Seq peak信息与基因结构信息进行批量可视化
31:17
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