2(试看)-温度和压力控制、周期性边界条件、分子动力学模拟流程
3(试看)-Linux 命令入门基础——掌握GROMACS所用的Linux命
5(试看) -GROMACS的Linux版编译安装
8(试看) -Packmol、GaussView、vmd等建模软件、分析工具的
9(试看)-界面模型、混合溶剂模型、纳米材料模型的建模
12(试看)-甲醇等极性溶剂的水溶液模拟以及添加离子环境的模拟—巩固掌握的命令、界面模型模拟—掌握气液界面、油水界面等界面模拟
14(试看)-碳纳米管的模拟—掌握周期性结构的建模方法
15(试看)-GROMACS自带分析工具讲解: 分析氢键性质、径向分布函数、扩散系数、离子配位数、各种能量性质计算、空间分布函数作图分析、 计算二维的平面或轴径
16(试看)- 蛋白建模—力场生成、模拟模型搭建、模拟流程
17(试看)- 分析蛋白二级结构、氢键性质、回旋半径、RMSF、溶剂可及面积、Ramachandran图
18(试看)- 蛋白配体复合物模拟—力场生成、模拟模型搭建、模拟流程
19(试看)-使用 gmx_mmpbsa 计算结合自由能
第21讲氢键多维分析-从全局统计到局部特征的计算方法-20250709
精品课加餐:刘建川 GROMACS TOP 实战 TOP-ITP 文件详解
精品课加餐:刘建川・GROMACS 如何做交联模拟