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单细胞测序的多样本整合和去除批次效应教程和结果解读

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2024-04-29 17:59:55

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数据可视化

医学研究生

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单细胞测序数据分析的质控教程和结果解读教学视频

07:37

单细胞测序的多样本整合和去除批次效应教程和结果解读

11:32

根据每种细胞的marker基因集来进行单细胞测序的细胞注释教程和结果解读

11:52

将整理的的细胞名称文件注释到seurat对象中并进行可视化教程和结果解读

10:41

提取部分分组的seurat子集进行后续分析或细胞的亚型注释

07:29

单细胞的msigdb的gmt基因集通路富集分析，可关注我直播间跟我学习生信和直播连麦讨论各种生信分析问题

13:03

单细胞的自定义基因集通路富集分析教程和结果解读，可关注我的直播间跟我学习生信和连麦交流讨论生信分析问题，平时晚上会跟大家生信生信答疑解惑和解答世间万物。

10:38

一组基因单细胞小提琴图的拼图绘制教程和结果解读，可关注我的直播间跟我学习生信和连麦交流各种生信问题，我跟大家直播答疑解惑和解答世间万物

08:12

单独绘制单细胞数据的每个基因的box plot教程和结果解读，欢迎关注我的直播间跟我学习生信和连麦交流各种生信问题，我晚上直播跟大家答疑解惑和解答世间万物

03:29

单细胞中一组基因的点图dot plot绘制教程和结果解读，欢迎关注我直播间跟我学习生信和连麦交流各种生信问题，我晚上直播跟大家答疑解惑和解答世间万物

09:16

一组基因在单细胞中的表达差异结果热图绘制和结果解读

06:11

根据所有差异基因绘制基因表达的聚类热图

04:28

绘制基本的密度图和表达数据集质控的密度图教程和结果解读

03:00

绘制分类占比簇状条形图,并加上总类别

03:31

绘制分类占比簇状条形图,不加上总类别

04:03

绘制基因组染色体区域的DMR差异甲基化区域的circos图

05:02

绘制分类占比簇状条形图,不加上总类别

06:41

有分组信息，特征变量映射为x轴,用分组信息填充颜色的百分比条形图

03:15

对数据进行melt,把分组信息+样本id作为x轴类别名称,特征变量作为填充颜色的百分比条形图

03:30

对数据进行melt，样本id映射到x轴，特征变量映射为填充颜色的百分比条形图

02:50

绘制正负水平对比条形图

03:03

根据GSE编号自动下载处理GEO数据提取出表达矩阵和样本分组信息

06:00

单独绘制单细胞中每个基因的violin plot

05:27

细胞比例在不同分组中的差异比较教程和结果解读

04:58

所有类型细胞中基因在不同分组的差异表达分析

06:39

单独绘制每个基因的feature plot教程和结果解读

07:30

单细胞一组基因的FeaturePlot拼图绘制教程和结果解读

06:49

读取甲基化beta矩阵文件的甲基化全流程一键分析

04:13

差异甲基化位点结果的棒棒糖图可视化教程和结果解读

06:44

读取数据目录下的idat文件的甲基化全流程一键分析

19:34

一组基因涉及的两个数值矩阵文件的多组学相关性分析

09:56

多种结果取交集并绘制维恩图教程和结果解读

06:16

1.WGCNA的表达数据预处理和查看是否有离群样本

04:26

登陆GWAS数据库将获取密匙添加到环境变量进行孟德尔随机化分析

05:47

2.WGCNA剔除离群样本教程和结果解读

04:58

3.WGCNA的软阈值计算教程和结果解读

03:33

4.wgcna的共表达网络构建教程和结果解读

07:08

5.wgcna的性状最相关的模块的散点图可视化

03:56

6.wgcna的TOM拓扑矩阵计算和导出到cytoscape

06:20

ssGSEA/GSVA单样本通路得分富集分析和结果解读

08:31

批量GSEA通路富集分析并将多个GSEA结果显示在一张图中

04:48

读取多个样本的单细胞表达矩阵文件构建seurat分析对象

13:55

TCGA的microRNA测序数据下载处理教程

04:27

查看一组基因或某个通路的一组marker基因哪些有差异表达

02:48

使用go和kegg导入指定通路数据集来富集指定的生物学通路

07:00

TCGA的RPPA蛋白表达芯片数据下载处理教程

04:42

TCGA拷贝数变异数据下载处理教程

04:27

TCGA突变数据下载和处理教程

07:04

下载GEO的series matrix表达矩阵

03:30

分析像铁死亡等通路marker基因在go,kegg富集的哪些通路里

06:38

可视化go和kegg富集结果中指定的生物学通路

08:45

根据GSE id和文件名构建下载链接批量下载和处理GEO数据

07:51

多物种的go和kegg通路富集分析和可视化结果解读

12:18

根据GSE id自动批量下载处理GEO数据

06:18

基因芯片或转录组等表数据的批量差异分析教程和结果解读

04:54

各种物种的基因芯片或转录组差异分析教程和结果解读

05:28

基因表达数据集中批次效应去除教程

03:42

GEO中多个数据集整合教程和结果解读

04:36

在表达数据文件和分组信息文件中剔除掉PCA聚类异常样本

04:25

表达数据集的PCA分群聚类分析和结果解读

04:21

基因表达芯片的矫正归一化处理和结果解读

03:59

基因表达芯片质控教程和结果解读

05:05

利用基因表达数据集构建ExpressionSet分析对象

04:53

从样本注释文件中提取出分组和子分组数据

03:37

从样本注释文件中提取出分组数据教程

04:52

从表达矩阵列名中匹配提取出分组信息

11:09

将提取的基因注释信息跟表达矩阵合并

05:30

从GEO的GPL注释文件中提取出基因探针对应基因名称的基因注释信息

06:54

RCC的panel芯片的多样本合并处理和提取出表达矩阵教程和结果解读

05:28

GEO中非CEL格式的基因芯片多样本整合归一化处理和提取表达矩阵

04:55

CEL芯片数据压缩包的多样本整合标准化和提取出表达矩阵

08:45

从GEO中下载的GSE压缩包的转录组RNAseq数据的多样本合并教程

05:47

同一物种不同类型基因id和名称转换直播教学和答疑

11:12

GSEA通路富集分析教程和结果解读

03:57

按某个分组绘制水平分面条形图，展示多种机器学习的特征基因重要性，代做生信分析和辅导

12:34

按某个分组列绘制汇总的平均秩次排序水平条形图,以机器学习的特征可视化为例完整版，代做生信分析和辅导

13:06

机器学习ROC曲线绘制的教程和讲解，代做生信分析和辅导完整版

18:33

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