分子动力学模拟(一):安装模拟软件gromacs

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2025-03-25 00:24:10
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分子动力学模拟从入门到精通系列第一集,按步介绍了如何安装gromacs软件,提供了所有代码;PPT及材料可以在https://github.com/Sept-naf/gromacs-tutorials自行下载。
无冥冥之志者,无昭昭之明;无惛惛之事者,无赫赫之功。
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简介
分子动力学模拟(一):安装模拟软件gromacs
27:49
分子动力学模拟(二):认识PDB与力场
20:45
分子动力学模拟(三):蛋白质体系的动力学模拟
27:50
分子动力学模拟(四):VMD轨迹可视化,动力学模拟轨迹后处理,RMSD与氢键的计算
23:42
分子动力学模拟(五):蛋白质配体复合物的动力学模拟(gromacs)
33:38
分子动力学模拟(六):一行命令使用mmGBSA计算蛋白质配体结合自由能,能量分解以及进行蛋白质配体复合物模拟
09:12
分子动力学模拟(七):膜蛋白的分子动力学模拟 - CharmmGui
23:12
分子动力学模拟(八):使用amber进行分子动力学模拟
22:30
分子动力学模拟(九):势能面与玻尔兹曼分布
26:24
分子动力学模拟(十):元动力学模拟 metadynamics 理论
18:29
分子动力学模拟(十一):元动力学模拟 metadynamics 案例
14:28
分子动力学模拟(可选): 元动力学模拟能做什么
07:18
分子动力学模拟(十二):如何使用amber进行高斯加速动力学模拟(GaMD)
12:17
(可选)(玩笑)用AI解读元动力学模拟原理
01:46
ChimeraX速成: 绘制可用于期刊的蛋白质配体相互作用图
19:24
手绘风蛋白作图
04:06
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