●2023年1月3日，澳大利亚西悉尼大学刘洪伟和张海洋组在iMeta在线发表了题为“Warmer and drier ecosystems select for smaller bacterial genomes in global soils”的文章。
● 本研究使用联合物种分布模型来量化环境对物种发生的影响。研究表明，增加更温暖和更干燥的生态系统的覆盖可能会通过减少基因组大小来简化细菌基因组。
● 第一作者：刘洪伟、张海洋
● 通讯作者：张海洋 (haiyang.zhang@westernsydney.edu.au)
● 主要单位：澳大利亚西悉尼大学霍克斯伯里农学院、河北大学生命科学院、西班牙塞维利亚自然资源和农业生物学研究所 (IRNAS)、西班牙巴勃罗·德·奥拉维德大学、澳大利亚西悉尼大学全球陆地创新中心
亮 点
● 种分布模型用于量化环境对细菌物种出现的影响
● 温暖干燥的环境有利于基因组较小的细菌
● 较高的土壤肥力（例如，磷）有利于基因组较小的细菌
摘 要
细菌基因组大小反映了细菌进化过程和代谢生活方式，对微生物群落组装和生态系统功能具有影响。然而，为了了解基因组介导的微生物对环境选择的反应程度，我们需要研究观察基因组大小沿着代表土壤细菌通常遇到的不同条件的环境梯度分布。在这项研究中，我们使用从全球237个地点收集的表层土壤，并使用细菌群落分析分析了环境条件（例如土壤碳和养分、干旱、pH值和温度）如何影响群落水平的土壤细菌发生和基因组大小。我们使用联合物种分布模型来量化环境对物种发生的影响，发现干旱是基因组大小的主要调节因子，温暖和干燥的环境选择基因组较小的细菌。干旱引起的对细菌生长的生理限制（例如，细胞代谢缺水）可能导致了这些相关性。这一发现表明，增加更温暖和更干燥的生态系统的覆盖可能会通过减少基因组大小来简化细菌基因组。
Liu, Hongwei, Haiyang Zhang, Jeff Powell, Manuel Delgado-Baquerizo, Juntao Wang, Brajesh Singh. 2023. “Warmer and drier ecosystems select for smaller bacterial genomes in global soils.” iMeta 2: e70. https://doi.org/10.1002/imt2.70
