iMeta | 西工大与中国农科院哈兽所联合发布FluNexus：抗原性预测和可视化平台
研究论文
● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)
● 英文题目: FluNexus: a versatile web platform for antigenic prediction and visualization of influenza A viruses
● 中文题目: FluNexus：用于甲型流感病毒抗原性预测与可视化的多功能网络平台
● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70127
● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70127
● 2026年5月2日，西北工业大学尚学群、李幸一，中国农业科学院哈尔滨兽医研究所孔晖晖、陈化兰，中国农业科学院长春兽医研究所刘艳和中南大学李敏等在iMeta在线发表了题为“FluNexus: a versatile web platform for antigenic prediction and visualization of influenza A viruses”的文章。本研究开发了一个用于甲型流感病毒抗原性预测与可视化分析的一站式网络平台 FluNexus。该平台集成了交互式数据预处理模块、在线抗原性预测模块以及甲型流感病毒抗原进化可视化模块，能够为相关研究提供便捷、高效的一体化分析支持。
● 第一作者：李幸一
● 通讯作者：孔晖晖（konghuihui@caas.cn）、陈化兰（chenhualan@caas.cn）、尚学群（shang@nwpu.edu.cn）、刘艳（liu820512@163.com）、李敏（limin@mail.csu.edu.cn）
● 合作作者：周春艳、吴涵、肖可昕、郝军、赵董旻、邓国华、李玥、辜嘉、蔡伟刚、朱军楠、彭佳杰
● 主要单位：西北工业大学计算机学院、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室、中国农业科学院长春兽医研究所、澳门城市大学数据科学学院、全球流感中心弗朗西斯·克里克研究所、中国科学院自动化研究多模态人工智能系统全国重点实验室、中南大学计算机学院
研究亮点
● FluNexus 提供了数据预处理模块，可用于处理 H1、H3 和 H5 亚型流感病毒的蛋白质序列及血凝抑制试验数据；
● FluNexus 集成了 10 种先进的抗原性预测工具，支持在线抗原性预测分析，并结合各工具的性能评估结果为用户提供实用参考；
● FluNexus 提供了抗原进化可视化模块，可用于绘制甲型流感病毒的抗原进化图谱，其中包含本研究提出的一种基于流形的新型抗原制图方法。
研究摘要
甲型流感病毒通过持续的抗原性进化逃避宿主免疫反应，进而导致季节性流感流行，甚至引发全球大流行。甲型流感病毒的抗原性预测与可视化对于精准筛选疫苗株和开展充分的大流行防范至关重要。然而，尽管相关需求十分迫切，目前仍缺乏一个兼具上述功能且用户友好的在线平台。因此，我们推出了 FluNexus（https://flunexus.com），这是一个旨在促进新变异株抗原性预测与可视化分析的一站式网络平台。FluNexus 集成了数据预处理模块，可处理H1、H3 和 H5三种具有重大公共卫生意义的亚型的血凝素亚基 1（HA1）序列及血凝抑制（HI）试验数据。同时，FluNexus 提供了用于在线抗原性预测的交互式界面，并结合各预测工具的性能评估结果为研究人员提供实用指导。尤为重要的是，FluNexus 能够可视化甲型流感病毒的抗原进化过程。具体而言，FluNexus 采用了一种基于流形的创新算法来定位抗原和抗血清，即使在 HI 数据稀疏的情况下，仍能较为准确地绘制抗原图谱。通过降低生物学家使用相关方法的编程门槛，FluNexus 有助于研究人员做出更科学的疫苗株选择决策，从而加强全球流感监测与大流行应对能力。
iMeta
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