《电锯人》第二部以电次的视角，展现了这位曾经的恶魔猎人在玛奇玛死后的生活轨迹。第一部结尾，电次吞噬玛奇玛后，成为了世人眼中的「电锯人英雄」，却选择隐藏身份，以普通高中生的身份就读于第四东高等学校，渴望过上「吃饭、女人、打游戏」的平凡生活。

他被公安安排的护卫吉田宽文监视，同时照顾着玛奇玛转世的小女孩那由多，过着看似平静的校园生活。然而，战争恶魔・夜的出现打破了这份宁静，她附身于三鹰朝，以杀死电锯人为目标不断接近电次。电次在与三鹰 / 夜的周旋中，逐渐对这个内心矛盾的女孩产生好感，甚至在她面前展现出难得的温柔与脆弱。

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与此同时，新的威胁不断涌现：附身班长的「正义恶魔」、四处捕食人类的「饥饿恶魔」、以及试图利用电锯人力量的神秘组织。电次在战斗中逐渐意识到，自己渴望的平凡生活与作为电锯人的宿命始终无法割裂。他开始重新思考力量的意义，以及自己与波奇塔的羁绊。

在最终话中，波奇塔在意识空间向电次坦白真相：电次追求的幸福假象，其实是波奇塔为他编织的梦境。为了让电次能真正过上平凡生活，波奇塔选择自我吞噬，彻底抹除电锯人在世界上的存在，重启整个时间线。新的世界里，电次回到最初的小破木屋，被帕瓦拯救，与那由多、帕瓦一起成为新的恶魔猎人，在学校中与三鹰朝重逢，仿佛一切都重新开始，却又带着宿命的轮回印记。