fmri处理reho、alff都是流水线处理,先blank,再选择。
workingDirectiory是start Directory的上一个层级。
start directory就是自己想从哪一步执行,比如数据预处理已经结束了,计算功能连接,那么start为FunImgARCWF。这样的前提是已经预处理完成生成FunImgARCWF这个文件了。
然后流水线只选择function connectivity和extract roi time courses

常用的流水线和解释

reho生成的文件夹和alff生成的文件夹
reho取szRehoMap开头的数据做统计分析、fAlff取fALFF_FunImgARCW下的zfALFFMap开头的数据做统计分析。
统计分析-dpabi下的statistical analysis

统计分析完后,生成Tp差异图像,用dpabi的Viewer的查看,可以设置voxel、校正、cluster导出save single cluster可以实现roi 模版导出


roi 信号的提取通过viewer导出的cluster模版提取,生成mask后,点击dpabi下的utilities下的roi signal extractor


mask就选择viewer提取出的mask
