流式细胞术免费学习资源清单(超全)
南京福麦斯生物
编辑于 2024年02月07日 18:16
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共32篇

流式细胞术是个有着独特魅力或魔力的方法学,为此聚集了一大批志同道合的人士。

无论是学习流式细胞术相关知识,查询实验方法,提升实验技能,了解前沿进展,结交良师益友,还是贡献经验和想法,都已有成熟的平台或社区。

我们整理了一些非常优秀的学习型资源平台,供大家参考学习!

一、介绍性资源

Part.1 《Practical Flow Cytometry》--Howard M. Shapiro(auth.)

下载地址:https://pan.quark.cn/s/61a9195ab658

对于任何有兴趣了解流式细胞术技术或有兴趣发展流式细胞仪应用专业知识的人来说,这是一本经典的参考书。

这本书详细介绍了使用激光激活检测和细胞分选的定量分析细胞学的广泛生物医学应用。

现在是第四版,本书已经扩展,全面涵盖了当今分子生物学和生物技术的广泛应用。

本版新增了有关阵列技术自动分析、补偿、高速分选、报告分子以及多重和细胞凋亡检测的章节,以及全面更新和修订的参考文献和供应商名单。

Part.2 Whitehead Institute

①Open flow initiative

网站:https://wi.mit.edu/open-flow-cytometry-videos

Open Flow是一个开放获取的流式细胞术教育资源平台。Open Flow 的现场互动课程每月举行一次,注册的人都可以免费参加学习。

Open Flow 计划是弗朗西斯·克里克研究所(英国伦敦)、纪念斯隆凯特琳癌症中心(美国纽约州)和怀特黑德生物医学研究所(美国马萨诸塞州剑桥)之间的合作项目。

②Flow Post-Its

网站:https://wi.mit.edu/flow-cytometry-core/resources/flow-post-its

Flow Post-Its诞生于纪念斯隆凯特琳癌症中心,现在是与怀特黑德生物医学研究所的合作教育项目。这里有非常多改进流式细胞术实验的提示和技巧,他们把每一个经验做成了图文式的便利贴,方便用户查阅与学习。

③Vendor websites(供应商网站)

供应商网站是一个很好的技术信息资源来源渠道。他们通常还提供protocols、技术支持和教育资源

主要供应商包括BD Bioscences、Cytek Bioscenes、 Beckman Coulter、 ThermoFisher、 Abcam和Biolegend等。

二、参考期刊

①Cytometry Part A

Cytometry Part A是一本定量单细胞分析杂志,以采用定量单细胞测量、分离、操作和建模技术的创新科学研究的原始研究报告和综述为特色。

Cytometry Part A上发表的OMIP,是经过同行评审的,旨在报道用于流式细胞术、荧光显微镜、成像细胞术和其他基于多色荧光的方法的新设计和优化的多色面板。

②Current Protocols in Cytometry

这本期刊全面收集细胞术protocols,专注于各种细胞群的检测和分析,包括仪器设置、数据处理和分析以及细胞和分子成像。

三、细胞术社区

Part.1 International Society for Advancement of Cytometry(ISAC) and Cytometry University (CYTO U)

①ISAC是全球细胞检测专业人员社区

ISAC的会员拥有大量的教育和网络学习机会,ISAC每年组织一次年度盛会(CYTO)。

网站:https://isac-net.org/?

②CYTO U

作为ISAC的一个在线门户网站,可用于按需、同行评审的细胞术教育。该网站提供多模块课程、提供CYTO会议的和网络讨会系列的录制内容。

网站:https://learning.isac-net.org/

Part.2 加入专业协会(Professional societies)

成为当地、地区、国家或国际细胞术专业协会的成员,将在那里获得学习、指导和建立联系的机会。此类组织包括:

①ACS(澳大拉西亚细胞术学会)

②LatinFlow(伊比利亚美洲国家细胞术学会)

③flowcytometryUK(英国细胞术学会)

此外,这些学会针对中心实验室专业会员提供有关细胞术学习和跟踪内容:

①CTLS(生命科学核心技术Core Technologies for life sciences)

②ABRF(生物分子资源设施协会Association of Biomolecular Resource Facilities)

Part.3 The Cytometry Society-INDIA(TCS,INDIA)

网站:https://tcs.res.in/about-society.php

该组织成立于2005年,组织研讨会(有/无SAC协会)和课程,并在印度提供了几份细胞术资源材料。

Part.4 Purdue Cytometry List

网站:http://www.cyto.purdue.edu/

普渡大学PUCL细胞术讨论列表建立于1989年,讨论内容向所有科学家开放,让他们提出问题或讨论细胞术领域关注的话题

Part.5 CyTOForum

网站:http://cytoforum.stanford.edu

CyTOForum成立于2014年,是一个面向所有质谱细胞术的开放式在线交流论坛。

四、细胞术数据库

Part.1 FlowRepository

网站:http://flowrepository.org/

FlowRepository是一个流式细胞术实验数据库,你可以在其中查询和下载根据MIFlowCyt标准(参考文献)收集和注释的数据

它主要用作发表在同行评审期刊上的实验结果的数据存放处。可以使用下面的表格和链接查询或浏览这些数据集。

Part.2 RRID

网站:https://scicrunch.org/resources

研究资源标识符(#RRID)是分配给研究人员的ID号,用于帮助研究人员引用生物医学文献中的关键资源(抗体、模型生物和软件项目),以提高研究方法的透明度。

五、实用工具

在流式多色实验方案设计中,除了试供应商帮我们设计Panel外,其实我们还可以查找资料,利用一些工具去更有效率,更完美的设计我们的实验方案。

Part.1 FluoroFinder

在线网站:https://fluorofinder.com/

FluoroFinder的网站收集了开始流式细胞术实验设计所需的资源,提供了综合抗体搜索、交互式仪器配置或光谱查看器等工具。

针对OMIP的文献进行了整理,把其中用到的抗体进行整理列表,查起来非常方便,一目了然,而且这些抗体都是经过验证的,用起来更可靠。

Part.2 Optimized Multicolor Immunofluorescence Panel (OMIP)

网站:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)1552-4930.OMIPscollection

OMIP是一种特殊的同行评审的 Cytometry Part A 出版物类型,报告了用于流式细胞术、荧光显微镜、图像流式细胞术和其他基于多色荧光的方法的新设计和优化的多色检测组合。

在OMIP中我们可以找到不同的Panel设计方案(免疫方向,文献内容包括marker的克隆号,marker表达的细胞类型,设计相应marker的目的,以及圈门策略,panel的评估等。也因此我们可以根据OMIP去设计自己的实验方案,而且还可以进一步加深我们的免疫知识。

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