2003年12月28日,中央电视台少儿频道开播,并《音乐快递》节目开播,日播版五分钟,周末版30分钟。
2004年,音乐快递调整为演唱赛形式。
2005年春节期间,音乐快递大约需要播出为60分钟。
2005年暑假期间,音乐快递推出暑期特辑《全国少儿歌手电视演唱大赛》在北京举行,2007年继续举办。
2006年,央视少儿频道改版,音乐快递周末版节目改版为45分钟。
2007年5月底至7月初,音乐快递推出《快乐儿歌总动员》歌曲展播,同年11月初,音乐快递推出历年央视六一晚会歌曲特辑。
2008年,央视少儿频道又一次改版,音乐快递与周末音乐快递合并,节目时长为60分钟,所以,该节目调整为擂台赛的形式。
2009年暑假期间,音乐快递推出《爱国歌曲大家唱》赛歌会。
2010年暑假期间,音乐快递推出暑期特辑,擂台争霸赛。
2011年1月19日,音乐快递改版,推出《爱音乐的请举手》系列。
2012年7月,音乐快递再次改版,推出《百分百动听》系列。
2013年11月,音乐快递推出两期特别节目《音乐快递开播十周年特别节目》以及《唱出心中最美的歌》两个节目。
2014年9月初,音乐快递推出《我的音乐梦想》系列。
2015年4月底,音乐快递推出《等你长大》系列节目,同年年底,音乐快递推出《点亮梦想》系列节目。
2016年1月4日,BoBo乐乐园的小嘉宾黄子桐,亮相央视《音乐快递》的舞台演唱《天之大》这首歌曲。
2017年10月中旬,音乐快递推出《梦想欢唱》系列节目。
2018年6月,为《音乐快递》栏目开播15周年既栏目合并十周年,音乐快递推出新节目《梦想儿歌汇》系列节目,同年十月,总台央视与麦当劳餐厅共同打造《麦当劳点亮梦想》绽放音乐舞台。
2019年5月底,第二季《点亮梦想》震撼播出,同年十月一日,音乐快递国庆特辑《新学堂歌》在C14改版前夕播出,同年10月9日,由于C14改版,音乐快递改回45分钟,推出《童声飘过70年》系列节目。
2020年,突如其来的新冠肺炎疫情,音乐快递推出归来还是少年以及月亮喊你来唱歌云面试录像。
2021年3月,为庆祝《音乐快递》开播十八周年,音乐快递推出《归来还是少年》以及《月亮喊你来唱歌》系列节目,同年六月底,音乐快递和全国少工委制作特别节目《红领巾心向党》歌曲演唱会,同年十月底,音乐快递播出一期央视动漫特别节目《我们都是好朋友》歌曲演唱会。
2022年1月12日、19日,音乐快递播出两期特别节目《天籁之声》新年晚会精编版,在央视少儿频道播出,同年1月26日,音乐快递播出冰雪专场,大年初二,音乐快递播出金虎纳福,正月初九,音乐快递播出航天专场,同年7月初,音乐快递暑假播出时间有些调整,第一周7月9日起07:15、第二周7月25日起06:30,第三周八月底起恢复07:15播出。
2023年6月21日,央视少儿频道《音乐快递》播出一期端午特别节目《金色童谣》在央视少儿频道播出,同年9月初,为庆祝《音乐快递》开播二十周年,所以《音乐快递》从室内演播厅改为户外演出,从9月初开始,音乐快递播出连续十三期的《草坪亲子音乐会》系列节目,同年年底,该节目已于2023年底正式停播。
2023年底,名师有名堂,官宣定档,陪伴着大家二十岁的《音乐快递》跟小歌手们与观众告别。