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LAMMPS入门到进阶教程:Python辅助建模,计算模拟,MDAnalysis辅助分析,及论文复现!
MS杨站长-华算科技
编辑于 2023年11月14日 01:22
收录于文集
共5篇

分子动力学软件中,LAMMPS (“Large-scale Atomic/ Molecular Massively Parallel Simulator”,大尺度原子/分子并行模拟工具)是名副其实的全能巨无霸。

可以对气态、固态、液态进行分子动力学模拟,研究体系包括但不仅限于合金、矿物、半导体、溶液、高分子、DNA、细胞膜、蛋白质,可调用多种势函数/力场,支持各种系综、粗粒化,能够实现对百万级原子分子体系的计算。

经过近一年的打磨,华算科技特推出覆盖领域超全面、亮点超多的LAMMPS培训,一个课程涵盖了所有分子动力学能模拟的性质,时长超过28小时

课程由资深技术专家王老师主讲,专为分子动力学初入门学员设计,沿着理论讲解、模型搭建、性质分析层层递进。带你学会分子动力学计算,早发顶刊!

模型搭建:

✅ 金属,合金,中熵、高熵合金,多晶金属,梯度金属等;

✅ 粗糙金属表面、孪晶界面的构建;

✅ 波浪石墨烯的构建;金属-石墨烯(碳纳米管)复合材料;

✅ 聚合物,共聚物,均聚物等;粗粒化模型(石墨烯)的构建;

✅ LAMMPS内置命令建模;ATOMSK建模软件的使用;

✅ CHARMM-GUI的使用;Packmol的使用;VMD构建多层石墨烯,碳纳米管模型;

✅ Python辅助构建模型(原子级别梯度金属)。

性质计算:

 金属、聚合物、及其复合材料的拉伸、压缩模拟;

 纳米压痕、冲击计算;热传导计算;

 聚合物的交联反应;

 超算批量提交LAMMPS计算任务。

结果分析

 径向分布函数(RDF)、概率分布函数(PDF)、

✅ 扩散系数、均方位移(MSD);

✅ 位错分析、表面张力、氢键寿命;

 力学性能(模量,屈服强度,toughness等);

 纳米压痕分析、玻璃化转变温度(Tg);

✅ 高分子拉伸过程链取向分析(结晶相关);

✅ MDAnalysis后处理分析模拟轨迹。

王老师:华算科技资深技术专家,六年以上LAMMPS软件重度使用经验。发表SCI共10篇,并参与编写英文书籍《Fundamentals of Multiscale Modeling of Structural Materials》。

主要研究领域为:利用分子动力学模拟方法,①研究金属(梯度和中、高熵合金)及其纳米复合材料的力学性能;②开发高分子和石墨烯的粗粒化模型,并研究高分子及其纳米复合材料的结构、动力学和力学性能。

主办单位:深圳华算科技有限公司(拥有VASP、Materials Studio、Gaussian商业版权)

培训形式:线上课程,28小时录播,无限次回看,课程群永不解散,随时提问,及时解答。

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