(1)胞质颗粒
https://en.wikipedia.org/wiki/Cytosol
1.1浓度梯度
尽管小分子在胞质溶胶中迅速扩散,但该隔室内仍可产生浓度梯度。一个经过充分研究的例子是“钙火花”,它在开放的钙通道周围的区域短时间内产生。[39]它们的直径约为2微米,仅持续几毫秒,尽管几个火花可以合并形成更大的梯度,称为“钙波”。
1.2细胞骨骼筛分
虽然细胞骨架不是细胞质的一部分,但这种细丝网络的存在限制了大颗粒在细胞中的扩散。
例如,在几项研究中,大于约25纳米(大约核糖体大小)的示踪剂颗粒被排除在细胞边缘周围和细胞核旁边的胞质溶胶部分。这些“排除隔室”可能含有比细胞质溶胶的其余部分更密集的肌动蛋白纤维网状结构。这些微结构域可以通过将它们排除在某些区域并将它们集中在其他区域来影响细胞质内大型结构(例如核糖体和细胞器)的分布。
1.3生物分子缩合物
非膜结合的细胞器可以形成生物分子缩合物,通过大分子的聚集、寡聚化或聚合产生,以驱动细胞质或细胞核的胶体相分离。
1.4蛋白质微隔室
https://en.wikipedia.org/wiki/Bacterial_microcompartment
一些蛋白质复合物包含一个大的中心腔,该腔从胞质溶胶的其余部分分离出来。这种封闭区室的一个例子是蛋白酶体。 在这里,一组亚基形成一个空心桶,其中包含降解胞质蛋白的蛋白酶。由于如果它们与细胞质的其余部分自由混合,它们会造成损害,因此桶被一组调节蛋白所覆盖,这些调节蛋白通过指示它们降解的信号(泛素标签)识别蛋白质并将它们送入蛋白水解腔。例如:蛋白酶体https://en.wikipedia.org/wiki/Proteasome
另一大类蛋白质隔室是细菌微隔室,它由包裹各种酶的蛋白质外壳组成。这些隔室通常直径约为 100-200 纳米,由互锁的蛋白质组成。例如:对微生物基因组序列数据的全面调查表明,BMC外壳封装了60多种不同的代谢功能。大多数参与碳固定(羧基体)或醛氧化(代谢体)。
1.6、P体或加工体
https://en.wikipedia.org/wiki/P-bodies
P 体是高度保守的结构,已在源自脊椎动物和无脊椎动物、植物和酵母的体细胞中被观察到。
迄今为止,P 体已被证明在一般 mRNA 衰变、无义介导的 mRNA 衰变、富含腺苷酸尿苷酸的元件介导的 mRNA 衰变和 microRNA (miRNA) 诱导的 mRNA 沉默中发挥重要作用。
在神经元中,P 体响应刺激而由运动蛋白移动。这可能与树突中的本地翻译有关。
P 体不等同于应激颗粒,它们包含大量不重叠的蛋白质。这两种结构支持重叠的细胞功能,但通常发生在不同的刺激下。Hoyle等人认为,一种称为EGP体或应激颗粒的新位点可能负责mRNA储存,因为这些位点缺乏脱帽酶。
1.7压力颗粒
https://en.wikipedia.org/wiki/Stress_granule
是细胞质中的生物分子缩合物,由蛋白质和 RNA 组成。
当细胞处于压力下时,它们组装成 0.1-2 μm 的无膜细胞器。
在应激颗粒中发现的 mRNA 分子是与 40S 核糖体亚基、翻译起始因子、poly(A)+ mRNA 和 RNA 结合蛋白 (RBP) 相关的停滞翻译起始复合物。虽然它们是无膜细胞器,但应激颗粒已被提议与内质网相关。
还有核应力颗粒。
1.8、TIGER 结构域
https://en.wikipedia.org/wiki/TIGER_domain
是一种次要的无膜细胞器,其中信使 RNA (mRNA) 编码某些类型的蛋白质以找到合适的生长环境。它在蛋白质合成过程中与内质网密切相关。科学家已经研究了所有类型的细胞,都发现了TIGER结构域。
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