【代码分享69】一文拿捏，泛癌之肿瘤与正常组织甲基化分析
尔云间
2024年06月18日 08:36

泛癌分析，依然是比较火热的话题，尤其结合多组学的方式来进行研究，成为了热点中的热点，跟着时代的潮流，今天小云想为大家分享一下如何进行泛癌中肿瘤与正常组织甲基化分析，接下来我们开始今天的学习。

为何做泛癌中肿瘤与正常组织甲基化分析？

启动子区DNA甲基化标记在基因表达的转录调控中有着很重要的地位，参与了很多生物学过程，因此通过甲基化分析结合转录表达，可以更好的来解释生物学意义，了解相关的调控机制。

今天小云通过数据下载，提取感兴趣基因集在肿瘤组织和正常组织中甲基化数据，最后绘制好看的气泡图，展示出不同肿瘤组织中感兴趣基因的甲基化状态，一文拿捏，泛癌甲基化分析，下面就跟着小云的节奏开始今天的学习之旅吧！

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BiocManager::install("ChAMP")
BiocManager::install("ChAMPdata")
BiocManager::install("ComplexHeatmap")
install.packages("ggpubr", "randomcoloR")
install.packages("ggplot2")
install.packages("data.table")
BiocManager::install("impute")
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library(randomcoloR)
library(ggpubr)
library(impute)
library(ComplexHeatmap)
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