复杂网络建模与分析:常用的分析与可视化工具
单哥的科研日常
编辑于 2022年03月26日 00:00

学习复杂网络建模这门课程之前,先给大家介绍几款常用的网络建模与可视化软件:Pajek、NetworkX、Gephi、Igraph等。

下图展示了Pajek的官方界面,大家可以去官网下载安装,该软件可以计算网络的一些基本结构特征,也可以可视化网络,第三张图就是一个网络可视化例子。

Pajek官方界面

Pajek软件界面

网络可视化示例

NetworkX是一个基于Python的复杂网络分析库,它是开源免费的,在复杂网络建模这门课程中我们会重点介绍该工具的使用方法。我们使用的是官方稳定版2.6.2,以下是官方界面:

NetworkX官方界面

另外,在它的官网也给出了大量可视化分析示例供我们学习。比如,这里用NetworkX生成一个ER随机图并将其可视化。总之,在后续的课程中我们会感受到它的功能非常强大,包含各种网络分析算法和可视化算法。

生成网络并可视化

第三款工具是Gephi,它更多地被用来做网络可视化分析,用它绘制的网络图非常漂亮,我们后期会开设专门针对Gephi的网络可视化课程,欢迎大家届时前来学习。

Gephi官方界面

Gephi网络可视化示例

最后推荐的是igraph,它是一款开源免费且高效的网络分析工具兼具网络可视化功能,支出R,Python,Mathematica,C和C++等多种语言,我们后续也会开设专门针对基于Python的Igraph讲解课程。

igraph官方界面

这里仅仅介绍了比较热门的四款工具,其中后面三款是我经常使用的。除此之外,还有很多网络建模与可视化工具,比如Ucinet以及一些在线可视化网站等,大家可以根据自己的使用习惯来选择合适的工具。后附四款工具的官方地址:

Pajek:http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/default.htm

NetworkX:https://networkx.org/

Gephi:https://gephi.org/

igraph:https://igraph.org/