第三章
1、剪接体（spliceosome）
剪接体是指由snRNP组成，介导转酯反应的巨型复合体，其大小为60S，snRNP是由5种核小RNA(U1、U2、U4、U5和
U6)，与几种蛋白质形成的复合物。这些小核RNA不会翻译出任何蛋白，但对于调控遗传活动起到重要作用。snRNP中的RNA成分与mRNA的5'端和3'端剪接点及分支点的保守碱基配对，经相互作用形成一个复合体，使前体mRNA折叠成利于剪切的正确构型。
2、RNA剪接
RNA剪接是指从DNA模板链转录出的最初
转录产物中除去内含子，并将外显子连接
起来形成一个连续的RNA分子的过程。
3、模板链
模板链，又称反义链，是指DNA双链中能作为转录模板通过碱基互补配对原则指导mRNA前体合成的DNA链。可作为模板转录为RNA的那条链该链与转录的RNA碱基互补(A-U，G-C)。在转录过程中，RNA聚合酶与模板链结合，并沿着模板链的3'-5'方向移动，按照5'-3'方向催化RNA的合成。
4、mRNA帽子
mRNA帽子是指由甲基化鸟苷酸经焦磷酸与mRNA的5'-端核苷酸相连，形成5'，5-三磷酸连接，是真核细胞中mRNA的5'端的一个特殊结构。通常有三种类型，
m7G5'ppp5'Np、m7G5'ppp5'NmpNp和m7G5'ppp5'NmpNmpNp，分别称为O型、|型和Ⅱ型。O型指末端核苷酸的核糖未甲基化；|型指末端一个核苷酸的核糖甲基化；Ⅱ型指末端两个核苷酸的核糖甲基化。
5、核心酶
核心酶是指由2个α亚基、1个β亚基、1个β’亚基和1个ω亚基组成的酶，大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基组成
(α2ββ'σω)。核心酶只能使已开始合成的RNA链延长，不具有起始合成RNA的能力，因此必须加入σ因子才能表现出全部聚合酶的活性。
第四章
1、tRNA三叶草形结构
tRNA的三叶草型结构是指tRNA的二级结构呈三叶草型，由3个环即二氢尿嘧啶环(该处二氢尿苷酸含量高)、反密码环(该环中部为反密码子)、TψC环[绝大多数tRNA在该处含胸苷酸(T)、假尿苷酸(ψ)、胞苷酸(C)顺序]，四个茎即D茎(与D环连接的茎)、反密码茎(与反密码环连接)、TψC茎(与TψC环连接)和氨基酸接受茎[又称CCA茎，因所有tRNA的分子末端均含胞苷酸(C)、胞苷酸(C)、腺苷酸(A)顺序，CCA是连接氨基酸所不可缺少的]，以及位于反密码茎与TψC茎之间的可变臂构成。
2、遗传密码
遗传密码又称密码子、遗传密码子、三联体密码，指将DNA或RNA序列以三个核苷酸为一组的密码子翻译为蛋白质的氨基酸序列，决定蛋白质中氨基酸顺序的核苷酸顺序，由3个连续的核苷酸组成的密码子所构成，以用于蛋白质合成。几乎所有的生物都使用同样的遗传密码，称为标准遗传密码；即使是非细胞结构的病毒，它们也是使用标准遗传密码。但是也有少数生物使用一些稍微不同的遗传密码。
3、终止密码子
终止密码子是指蛋白质翻译过程中终止肽链合成的信使核糖核酸(mRNA)的三联体碱基序列，在mRNA翻译过程中，起蛋白质合成终止信号作用的密码子。终止密码子不代表任何氨基酸，不能与tRNA的反密码子配对，但能被终止因子或释放因子识别，终止肽链的合成。64个密码子中存在三个终止密码子，即UAG、UAA和UGA。
4、稀有碱基（minor base）
稀有碱基又称修饰碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但它们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。例如5-甲基胞苷、5，6-双氢尿苷等。tRNA中含有修饰碱基比较多，有的tRNA含有的稀有碱基达到10%。
5、可译框架、可读框（ORF）
可译框架、可读框(ORF)又称开放读码框或开放阅读框，是指一组连续的含有三联密码子的能够被翻译成多肽链的DNA序列。它由起始密码子开始，到终止密码子结束。可读框有可能编码一条多肽链或一种蛋白质。当没有已知蛋白质产物时，该区域被称为可读框，而当确知该可读框编码某一蛋白时，它就被称为编码区，即一个可读框是潜在的编码区。很多情况下，可读框即指某个基因的编码序列。
6、起始因子（原核中IF，真核中eIF）
起始因子(原核中IF，真核中eIF)是指翻译起始所必需的特异蛋白因子。与核糖体、信使核糖核酸、起始转移核糖核酸等组成动态翻译起始复合体。真核和原核生物翻译起始因子分别有eIF1～6和IF1～3等，在翻译开始之前，核糖体小亚基先与起始因子结合，然后与模板mRNA结合，最后与结合有氨酰-tRNA的大亚基结合形成起始复合物。
7、氨酰t-RNA合成酶（amino acyl-tRNAsyn-thetase）
氨酰-tRNA合成酶又称氨酰tRNA连接酶、氨基酸活化酶，是一类催化氨基酸与tRNA结合的特异性酶，该酶对特定的氨基酸和tRNA具有高度的专一性。因为具有这样高专一性底物的酶，所以mRNA的遗传信息能准确无误地反映在蛋白质的氨基酸序列上。其催化的反应分为两步：第一步是氨基酸活化生成酶-氨酰腺苷酸复合物，第二步是氨酰基转移到tRNA3'端腺苷残基的2'-OH或3'-OH上。
8、编码链与反义链（antisense strand）
编码链，又称有意义链，是指在转录过程中，双链DNA中不能进行转录的那一条DNA链，该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。
反义链，又称模板链，是指另一条根据碱基互补配对原则指导mRNA合成的DNA链。
9、分子伴侣（molecular chaperone）
分子伴侣是指广泛存在于原核生物和真核生物细胞中的结构上互不相同的蛋白质家族。它们能识别肽链的非天然构象，促进蛋白质的正确折叠和组装，保护蛋白质分子免受其他蛋白质的干扰。很多分子伴侣属于热休克蛋白(如HSP60)，它们在细胞受热时大量合成。热激可导致蛋白质稳定性降低，增加错误折叠的几率，因此在受到热刺激时，细胞中的蛋白质需要更多热休克蛋白的帮助，而且在组装完毕后与之分离，不作为这些蛋白质结构和执行功能时的组分。
