Primer-BLAST

• Primer-BLAST由NCBI开发，利用Primer3平台结合BLAST算法。

• BLAST 的结合能够筛选潜在的引物以针对生物体基因组中的非预期序列，这是一 个极其重要的特征。

• 提供有关引物将在目标序列上结合的位置的信息性视觉输出。

Primer3

• Primer3 具有非常简约的感觉，但是它具有非常强大和全面的引物设计能力。 有大量参数可供调整，以找到最适合您目标的引物组。

• 建议需要设计更复杂实验的用户利用 Primer3。

Primer3Plus

• Primer3Plus是另一个引物设计界面，它基于Primer3平台,它比Primer3更加对用户友好，每个引物参数都分隔到多个选项卡上。

 PerlPrimer 

• 是一个可以免费下载的开源 GUI 程序。还可以使用 NCBI 服务器对引物进行 BLAST，这对于任何优秀的引物设计平台来说都是必不可少的。

OLIGO

• OLIGO 是另一种可免费下载的引物设计软件。OLIGO 还允许设计用于qPCR的 TaqMan探针。

GenScript Real-time PCR (TaqMan) Primer Design

• 该引物设计在线工具特别适用于TaqMan引物和探针的创建。使用最少的引物参数设置，既好又简单。

• 可以自定义 PCR 扩增子大小、引物和探针Tm，并选择让引物/探针穿过外显子连接点。

 Eurofins Genomics’ Primer Design Tools

• 该设计工具使用GCG Wisconsin Package中的Prime+程序。

• 需要的只是一个目标序列，该序列被复制并粘贴到程序中，然后您可以选择调整设计参数。 输出还包括用于每个引物对的建议退火温度。

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