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国家基因库都在推荐的单细胞课程
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2023-06-20 09:25:22
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2025年 生信基地终于建成啦!
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编程小白打开单细胞的正确方式
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与生信大佬连麦对线
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与生信大佬连麦对线
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Topic1 生信学习 狂敲代码和玩转思路孰轻孰重
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Topic2 临床和科研如何结合出成果
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Topic3 生信分析和实验结果谁更靠谱?
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Topic4 生信学习的必修课是什么?
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Topic5 生信硕士应该如何打破就业寒冬?
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Topic6 如何投奔到很match的团队
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Topic7 空间转录组讨论
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scFAST-seq单细胞全序列分析教程
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01.绪论
13:13
02.准备工作
15:25
03. fast模块
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04. Seurat分析
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05. mutation模块
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国家基因库都在推荐的单细胞课程
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SCENIC单细胞转录因子预测
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01.绪论
17:12
02.学习手册
03:32
03.软件安装与数据准备
16:53
04.精简版流程
16:42
05.拆分步骤 Step1 基因共表达网络构建
11:26
06.拆分步骤 Step2 基因调控网络 Regulon构建
21:36
07.拆分步骤 Step3 利用AUCell对Regulon评分
12:07
08.拆分步骤 Step4 二元矩阵
08:38
09.拆分步骤 Step5 Regulon活性降维分析
06:32
10. 拆分步骤 Step6 下游探索工作
14:27
11. SCENIC调控网络绘制
18:10
生信Python速查手册
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单细胞图片改造计划
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改造单细胞降维图| 1.DimPlot的探索
22:25
改造单细胞降维图| 2.ggplot2中的DIY
31:14
改造单细胞降维图| 3.3D降维图与动图绘制
16:11
改造单细胞降维图| 4.一些造好的轮子
11:41
VlnPlot用法及其ggplot复现
18:10
VlnPlot的ggplot2改造
19:28
改造FeaturePlot
13:15
单细胞Figure1常见图片
24:16
DotPlot美化
24:31
DoHeatmap改造
34:51
生物信息学概论与进展
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生信小白的Linux保姆级教程
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第一讲 计算机的硬件组成
18:38
第二讲 计算机软件组成与Linux
40:12
第三讲 免费获得Linux系统-WSL
09:30
第四讲 免费获得Linux系统-虚拟机
09:48
第五讲 免费获得Linux-服务器
06:47
第六讲 服务器连接新范式
07:47
第七讲 命令行与基本命令
19:16
第八讲 获取Linux命令帮助的几种方式
07:45
第九讲 Linux的文件目录系统
12:04
第十讲 路径查看与切换: pwd,cd,ls命令
23:56
第十一讲 通配符
18:36
第十二讲 文件删除: rm命令
14:17
第十三讲 文件的复制(cp)与移动(mv)
12:18
第十四讲 用户与组群概念
18:16
第十五讲 用户管理命令(useradd, passwd, userdel, su)
22:03
第十六讲 文件权限管理: chmod, chown命令
18:41
第十七讲 快捷键
11:11
第十八讲 输出重定向 > >>
17:51
第十九讲 管道符 |
08:54
第二十讲 文件查找 find, locate, which
25:23
第二十一讲 别名 alias
11:58
第22讲 软链接与硬链接 ln
12:48
第23讲 (解)压缩与md5校验
24:05
第24讲 文件查看 wc, cat, head, tail
18:27
第25讲 文本浏览器 more, less
08:38
第26讲 文本编辑器 vim
34:07
第27讲 文本处理 cut, paste
13:26
第28讲 文本处理 sort uniq
09:01
第29讲 正则表达式
19:40
第30讲 文本处理 grep
07:09
第31讲 文本处理 sed命令
24:35
第32讲 文本处理 awk命令
24:18
第33讲 shell脚本
08:13
第34讲 shell变量
19:52
第35讲 if条件语句
15:19
第36讲 循环
18:19
后续安排
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科研界怎会有如此不肃之风
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《单细胞转录组测序分析》之 《拟时序分析》
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拟时序分析绪论
22:34
monocle绪论
23:12
monocle2实操 1.精简版拟时序
08:35
monocle2实操 2.安装
09:55
monocle2实操 3.monocle对象的创建与转换
11:14
monocle2实操 4.初探monocle
26:17
monocle2实操 5.拟时序分析
29:21
初识monocle3
49:41
monocle3的分群聚类与降维
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monocle3拟时序分析
24:58
解决orderCell函数报错的两种方法
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一文搞定拟时序分析的下游探索
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不学编程 零代码完成单细胞测序数据分析: loupe browser
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01. 软件安装
06:06
02. 页面布局,拆分视图工具,差异基因可视化
09:25
03. 利用marker基因找到指定细胞亚群
04:40
04. 利用过滤模式找到指定细胞亚群
08:18
05. 数据面板,热图工具,找区分不同样本的特征基因
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06. 数据面板导出表格信息,找不同样本同一亚群差异基因
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《单细胞转录组测序数据分析》——《细胞通讯》
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进阶分析第一讲 细胞通讯绪论
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Cellchat基础分析代码、结果一览
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CellChat基础分析教程 实操
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CellChat更新,projectData不能用啦
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文献阅读系列(十二)、IgAN & STRT-Seq
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Summary
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企业级pheatmap 手把手教你画热图
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给你安排一个懂生信的工具人
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pheatmap在线版教程
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再也不怕安装R包了
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在线PCA分析
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在线查询KEGG中通路与基因对应关系
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KEGG查询2.0
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富集分析App
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高阶韦恩图 UpSetR.App
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十分钟带你全方位了解单细胞测序
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保姆级教程 《手把手教你做单细胞转录组测序数据分析》 'Biomamba生信基地'公众号制作
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单细胞数据基础分析学习手册
03:30
第一讲 绪论
09:37
第二讲 数据读取
08:37
第三讲 单样本分析
31:38
第四讲 多样本整合
12:02
第五讲 细胞类型注释
27:47
第六讲 组间差异及可视化
22:45
第七讲 基因集富集分析
33:41
Seurat中分类变量处理技巧
25:31
Seurat中的亚群分析
19:34
沉浸式统计细胞比例
17:08
改造单细胞降维图| 1.DimPlot的探索
22:25
改造单细胞降维图| 2.ggplot2中的DIY
31:14
改造单细胞降维图| 3.3D降维图与动图绘制
16:11
改造单细胞降维图| 4.一些造好的轮子
11:41
小提琴图基本用法与ggplot2复现
18:10
vlnPlot的ggplot2改造
19:28
改造FeaturePlot
13:15
单细胞Figure1常见图片
24:16
DotPlot美化
24:31
DoHeatmap改造
34:51
拟时序分析| 01.绪论
22:42
拟时序分析| 02.monocle绪论
23:20
拟时序分析| 03.monocle2精简版
08:42
拟时序分析| 04. monocle2安装
10:02
拟时序分析| 05. monocle对象的创建与转换
11:21
拟时序分析| 06.初探monocle
26:17
拟时序分析| 07.monocle2拟时序分析
29:28
拟时序分析| 08.初识monocle3
49:41
拟时序分析| 09.monocle3的分群聚类与降维
33:07
拟时序分析| 10.monocle3的拟时序分析
24:58
拟时序分析| 11.解决orderCell函数报错
08:34
拟时序分析| 12.下游探索
29:44
细胞通讯| 01.绪论
25:48
细胞通讯| 02.CellChat基础分析教程
01:06:58
细胞通讯| 03.CellChat 多组别分析
30:23
CellChat更新,projectData不能用啦
02:23
SCENIC转录因子预测| 01.绪论
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SCENIC| 02.学习手册
03:32
SCENIC| 03.软件安装与数据准备
16:53
SCENIC| 04.流程精简版
16:42
SCENIC| 05.Step1 基因共表达网络构建
11:26
SCENIC| 06.Step2 Regulon构建
21:36
SCENIC| 07.Step3 AUCell score计算
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SCENIC| 08.Step4 二元矩阵
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SCENIC| 09.Step5 Regulon活性降维分析
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SCENIC| 10.Step6 下游探索工作
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SCENIC_11.调控网络绘制
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下个系列请期待
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scTenifoldKnk单细胞虚拟基因敲除| 理论
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scTenifoldKnk单细胞虚拟基因敲除| 模拟数据与肺泡单细胞数据实操
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