miRNA数据库简介及miRNA靶基因批量预测_哔哩哔哩

苹果手机用户请尽量使用电脑端购买，以免增加不必要的费用。本课程理论结合实战讲解miRNA靶基因预测。介绍了miRNA相关的常用数据库，miRBase，miRTarBase，miRcode，starbase，Targetscan。实战部分，介绍了如何使用R代码基于starbase和targetscan数据库中的数据，批量预测miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA之间的调控关系。本课程一共包含13节课程， 1.第一节，介绍miRBase数据库，以及如何从miRBase数据库下载miRNA数据 2.第二节，介绍miRTarBase数据库 3.第三节，介绍miRcode数据库 4.第四节，介绍starbase(ENCORI)数据库，以及利用starbase预测miRNA-mRNA之间调控关系 5.第五节，利用starbase预测miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间调控关系，以及其他RNA-RNA之间相互调控关系，还有ceRNA网络鉴定。 6.第六节，介绍starbase的pancancer功能，如何画基因表达箱型图，生存曲线以及表达相关性散点图 7.第七节，基于starbase所有的预测结果(已经帮大家下载好了人和鼠的所有预测结果，可以直接使用)，利用R代码批量预测miRNA-mRNA之间的调控关系 8.第八节，基于starbase所有的预测结果(已经帮大家下载好了人和鼠的所有预测结果，可以直接使用)，利用R代码批量预测miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA之间的调控关系 9.第九节，介绍Targetscan数据库，如何查找miRNA的靶基因以及通过靶基因查找调控的miRNA 10.第十节，下载Targetscan预测结果以及注释文件 11.第十一节，基于Targetscan所有的预测结果，利用R代码批量预测miRNA-mRNA之间的调控关系 12.第十二节，windows下如何安装R和Rstudio软件 13.第十三节，mac下如何安装R和Rstudio软件

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