专栏/百蓁技术篇丨免疫肽组分析服务

百蓁技术篇丨免疫肽组分析服务

2022年05月10日 01:48--浏览 · --点赞 · --评论
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免疫肽组是指对有核细胞在参与抗原呈递途径中的MHC I类或II类蛋白质(Major Histocompatibility Complex ,也叫主要组织相容性复合体,如人类MHC的表达产物HLA,Human Leukocyte Antigen)上呈递全部多肽的研究,对于探究了解细胞介导和体液反应中的免疫原性表位至关重要。

免疫肽组分析是对 I 类和 II 类免疫肽的动力学和组成的研究,不仅能够发现个性化癌症免疫疗法的靶点(例如来自肿瘤特异性突变的新抗原或肿瘤相关抗原),还有助于开发新的mRNA /多肽疫苗和免疫细胞疗法。

图 | HLA-I呈递途径及典型&非典型抗原肽产生过程


BSI公司在2021年报道了AI-助力质谱技术平台DeepImmu (X. Chen, et al. USHUPO, 2021) 用于免疫肽组分析,百蓁生物基于DeepImmu技术平台致力于在高效的项目实施周期下为客户提供可靠的结果。

百蓁生物运用高灵敏、高通量的免疫肽富集和鉴定技术为客户提供一站式免疫肽组分析服务解决方案,可识别与药物发现研究相关的 10,000 多种 I 类和 10,000 多种 II 类肽,DeepImmu技术平台在降低了样品量的同时能够可重复地鉴定并定量出尽可能多的免疫肽。

技术流程


1、蛋白质提取;

2、根据目标等位基因设计针对性抗体;

3、通过抗体亲和层析富集 MHC 复合物;

4、通过色谱技术手段,纯化 HLA 多肽;

5、通过高分辨质谱检测 HLA 多肽;

6、运用 DeepImmu 平台分析免疫肽组信息。

服务优势

百蓁生物采用AI驱动的质谱技术平台DeepImmu进行免疫肽组分析,与常用的NGS结合计算机预测技术和质谱结合外显子测序技术相比,该技术的优势

1、基于质谱的肽段鉴定方法可以更直接、准确地鉴定到免疫肽;

2、质谱数据de novo从头测序技术,不依赖于已有数据库,可以发现更多的非典型免疫肽;

3、可以分析NGS技术无法获得的免疫肽潜在翻译后修饰信息;

4、特有的AI算法,不依赖于个性化测序,提高了免疫肽组分析的效率。


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